土壤中的微生物资源非常丰富,原核生物细胞含量大约1×10^7个/g,但用传统技术培养的微生物仅占微生物总数的0.01%~10%,且大部分微生物处于不可培养的状态,使相当多的菌种不能被充分地开发和利用。
由于土壤微生物成分复杂,常规提取总DNA的方法难以去除腐殖酸,而微量的腐殖酸便可抑制PCR扩增中的TaqDNA聚合酶以及酶切反应的限制性内切酶活性。另外,土壤质地和成分的差异也会影响土壤微生物DNA的提取效果.
国内外学者对不同的土壤DNA提取和纯化方法进行了比较研究,现行土壤微生物基因组DNA提取方法可分为直接法和间接法2类,直接法采用原位裂解土壤微生物提取DNA(一般采用直接法),间接法采用速差离心回收菌体,裂解菌体提取DNA.间接法会大大降低土壤中腐殖酸,重金属盐对DNA提取带来的影响,但是这种方法会丢失许多微生物,得到的DNA并非土壤样品中的全基因组(宏基因组)。
如何从土壤样本中提取纯化DNA?艾美捷土壤DNA提取纯化试剂盒或许可以帮你解决这个难题。
艾美捷土壤DNA提取试剂盒特点如下:
1.快速简便的土壤样品中微生物检测方法;
2.处理所有土壤类型,包括常见的土壤样品和腐植酸含量高的难处理的土壤样品,如堆肥和粪肥;
3.使用OSR(Organic Substance Removal)溶液去除有机物质;
4.从DNA样本中去除所有腐殖酸;
5.使用快速离心柱形式进行快速简便的处理;
6.从包括细菌、真菌和藻类在内的各种微生物中分离出高质量的总DNA;
7.纯化的DNA质量很高,完全兼容下游PCR应用,因为在分离过程中去除了腐殖酸物质和PCR抑制剂。
艾美捷土壤DNA提取试剂盒样品使用量与DNA产出数据参考:
土壤zui大上样量 | 250mg |
处理的土壤类型 | 所有土壤类型 |
纯化柱zui大结合载量 | 50 ug |
纯化柱-zui大液体输入体积 | 650 uL |
10个样品的纯化时间 | 30 minutes |
艾美捷土壤DNA提取试剂盒操作流程图:
来源:艾美捷
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