荧光染料是指吸收某一波长的光波后能发射出另一波长大于吸收光的光波的物质。它们大多是含有苯环或杂环并带有共轭双键的化合物。荧光染料可以单独使用，也可以组合成复合荧光染料使用。

荧光染料由于灵敏度高，操作方便，逐渐取代了放射性同位素作为检测标记，其广泛应用于荧光免疫，荧光探针，细胞染色等。包括特异性的DNA染色，用于染色体分析、细胞周期、细胞凋亡等相关研究。另有很多核酸染料在多色染色系统中是非常有用的复染剂，可作为背景对照，标记细胞核使细胞内结构的空间关系一目了然。

免疫分析

荧光标记的单克隆抗体技术为流式细胞仪在研究细胞膜和细胞内各种功能性抗原、肿瘤基因蛋白等领域扩展了无限的应用空间。荧光探针可以通过蛋白质交联剂共价结合在单克隆抗体上。免疫荧光标记zui常用的染料有异硫氰酸荧光素(fluorescein isothiocyanate, FITC)、藻红蛋白（PE）以及AlexaFluor系列染料等。

核酸检测

核酸荧光染料对细胞核染色后定量测量细胞所发出的荧光强度，就可以确定细胞核中DNA、RNA的含量，并可以对细胞周期和细胞的增殖状况进行分析。有多种荧光染料可以对细胞中的DNA或RNA染色，常用的DNA染料包括碘化丙啶(PI)、DAPI、Hoechst 33342等，RNA染料有噻唑橙、吖啶橙等。

活性荧光染料及其衍生物广泛用于共价标记生物分子，例如抗体，碳水化合物，核酸，蛋白质，肽和寡核苷酸。各活化官能团对应的反应基团如下：

琥珀酰亚胺酯（Succinimidyl esters）/ NHS酯-用于标记抗体，蛋白质，肽，胺修饰的寡核苷酸和其他生物分子上的游离氨基（-NH 2）

马来酰亚胺（Maleimides）-用于标记抗体，蛋白质和肽上的巯基

叠氮化物(Azides)-通过点击化学法（Click）标记乙烯基

炔烃(Alkynes)-通过点击化学方法标记叠氮化物

酰肼(Hydrazides)-用于标记醛基和酮基

羧酸(Carboxylic acids)-经碳二亚胺预活化后用于标记胺或用于醇的Steglich酯化

氨基(Amines)-具有游离氨基的荧光染料，用于与各种亲电子化合物（如活化的酯和环氧化物）偶联。

四嗪（Tetrazines）-通过反电子需求Diels-Alder反应标记反式环辛烯(TCO)，环丙烯和其他活化的烯烃。

亚磷酰胺(Phosphoramidite)-亚磷酰胺标记的染料可用于标记寡核苷酸

环炔(Cycloalkyne)-具有环炔基部分的染料可用于无铜点击化学反应。

文章来源：艾美捷科技