DCS系统软件故障是软件本身所包含的错误所引起的。软件故障又分为系统软件故障和应用软件故障。系统软件是DCS系统所带来的，若设计考虑不周，在执行中一但条件满足就会引发故障，造成停机或死机等现象，此类故障并不常见。应用软件是用户自己编定的，在实际工程应用中，由于应用软件工作复杂，工作量大，因此应用软件错误几乎难以避免，这就要求在DCS系统调试及试运行中十分认真、仔细，及时发现并解决。

软件故障包括：
①程序错误，设计、编程和操作都可能出现程序错误，特别是联锁、顺控软件，不少问题是由于工艺过程对控制的要求未被满足而引起的。我厂#2炉乙侧给煤机顺控启动时，发现顺控启停中步序时间有效的问题就属于程序错误。
②组态错误：设计和输入组态数据时发生错误，这可以调出组态数据显示进行检查和修改。我厂#1炉主给水自动调节系统调节范围过窄，就是副调节器参数设置输入组态数据时忽略了负值引起的。
这一类故障不容易发现，就需要热控人员对DCS系统有比较深入的了解才行，而且要在不影响机组正常运行的条件更改参数。