集成的方法是对生产相关的业务流程进行疏理和优化，通过流程来把MES系统软件和ERP整合到一起，基于流程在MES系统软件和ERP之间的“进”和“出”来设计两个系统间的接口。

ERP与MES系统软件一起构成计划、控制、反馈、调整的完整闭环系统，通过接口进行计划、命令的传递和实绩的接收，使生产计划、控制指令、实时信息在整个ERP、MES系统软件、过程控制系统、基础自动化的体系中透明、及时、顺畅地交互传递。

实现MES系统软件与ERP的整合，关键在于业务流程的优化和整合以及对所涉及MES系统软件和ERP系统的具体分析以充分发挥各系统的长项。

信息系统都是为业务服务的，MES系统软件和 ERP各自解决一部分业务问题，分别反映一部分业务流程，流程是MES系统软件与ERP整合的“粘合剂”，通过流程的整体优化划分出哪些流程在MES系统软件中处理、哪些 流程在ERP中处理。